HPLC käigus kantakse segu komponendid statsionaarse faasi ajal liikuva faasi vooga üle ja eraldamine põhineb proovi komponentide migratsioonikiiruse erinevustel. Sellepärast sõltub analüüsitavate ainete laadist nii meetod kui ka HPLC-süsteemi valik
Analüüdi peamised tunnused:
MOLEKULMASS mõjutab statsionaarse faasi pooride suurust
LAHUSTUVUS määrab HPLC režiimi, statsionaarse faasi keemia ja eluendi.
KONTSENTRATSIOON JA MAATRIKS määravad tuvastusparameetrid ja kolonni mõõtmed.
Analüütide lahustuvus määrab HPLC režiimi. Elutroopsed sarjad kirjeldavad lahusti langust kõige sagedamini kasutatavatel kromatograafiarežiimidel – normaalse ja pöördfaaside kromatograafia korral.